Extraer varias lineas de texto

[Andrés Flórez]

Hola Jesus:

la verdad no pude extraer las lineas, podrías ayudarme de nuevo..

gracias

El día 26/10/07, Jesus Serrano <nevermind9 en gmail.com> escribió:
>
> On 10/26/07, Andrés Flórez <andrewflorez en gmail.com> wrote:
> >
> >
> > Hola a todos:
> >
> > Tengo una dificultad para manipular archivos de texto:
> >
> > Un archivo tiene varias lineas de la siguiente forma:
> >
> > linea indicadora:
> >
> > >Nombre de la secuencia
> >
> > siguiente linea:
> >
> > cadena de caracteres.
> >
> > AKGKA ......
> >
> > Ejemplo:
> >
> > >LmjF02.0410|RNA-editing complex protein MP81, putative
> > MHTAVLRQLSTPSTRPSGTANGGFGSSGVRDGSAPAPPSRGDGAATAPQQRSSHGVSSEL
> > >LmjF26.0390|RNA editing 3' terminal uridylyl transferase 2,RET2, RNA
> > editing complex MP57
> > MHAPTPLYLYVAVTRGLCSSAVAASSSADAASSPSAASSSTSEGVSYASHLVASNDHYVQ
> >
> >
> > Necesito redireccionar a un archivo de texto  por ejemplo la linea que
> > dice >LmjF02.0410|RNA     HASTA   EL FINAL DE LA CADENA DE CARACTERES,
> > MEJOR DICHO HASTA ANTES DONDE EMPIEZA LA SIGUIENTE LINEA  CON EL SIGNO >
> >
> > En otras palabras necesito extraer un intervalo desde una linea > con un
> > nombre hasta la proxima linea > con otro nombre
> >
> >
> > Les agradezco mucho cualquier ayuda.
> >
>
> ¿Te sirve eso?
>
> cat archivo.txt | grep ">LmjF^[>]"
>
> Lo anterior te extrae del texto las lineas que comienzan por ">LmjF"
> (según te ejemplo) seguido de cualquier cosa que *no* sea un nuevo símbolo
> ">". No obstante, debes saber qué se diferencia entre una línea que quieras
> extraer y otra que no (por ejemplo, el número de después de "LmjF", porque
> de este modo te extraería el fichero completo.
>
> Un saludo.
>
> --
> Jesús Serrano Sánchez-Toscano
> [ Ubuntu User #6321 ]
> --
> ubuntu-es mailing list
> ubuntu-es en lists.ubuntu.com
> https://lists.ubuntu.com/mailman/listinfo/ubuntu-es
>



-- 
Andrés F. Flórez

Associate Researcher
PECET.
Universidad de Antioquia.
Medellín-Colombia.
Carrera 53 # 61 - 30
Phones: (574) 210 6507 / 02
Fax: (574) 210 6511
Cell phone: 3103462268
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